献给初学者:常用的线粒体凋亡检测方法

2021-12-20 01:30:58 来源:
分享:

在实验之前经常需侦测巨噬细细胞核的衰老持续性,这里归纳了几种常见的衰老侦测方法律条文有,希望很难帮到你。

一巨噬细细胞核衰老的灵长类侦测

遭遇衰老的巨噬细细胞核在有机体上有一定的特征。

光学上端径和倒置上端径

未染巨噬细细胞核:衰老巨噬细细胞核的棒状积变小、变形,巨噬细细胞核表皮完整但单单现塑胶持续性,巨噬细细胞核衰老后期可见衰老小棒状。贴壁巨噬细细胞核单单现皱缩、变圆、脱落。

染巨噬细细胞核:常用姬姆萨染、瑞氏染等。衰老巨噬细细胞核的染质挥发、长期以来时,反应器表皮氢化时、染质分割变为块状和衰老小棒状等迥然不同的衰老有机体。

发光上端径和共揭示脉冲扫描上端径

一般以巨噬细细胞核内染质的灵长类变动为这两项来入围者巨噬细细胞核衰老的进展持续性。

常用的 DNA 甲基化染色有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三种染色与 DNA 的紧密结合都都是嵌入式的,主要紧密结合在 DNA 的 A-T 双链区。紫外光可借时发射成功明亮的白色发光。

Hoechst 是与 DNA 特异紧密结合的光阴性染色,存收试管用蒸馏水配变为 1 mg/ml 的浓度,常用时用 PBS 挥发,惟有浓度为 10 μg/ml。

DAPI 为半通透性,常用常规单独巨噬细细胞核的染。存收试管用蒸馏水配变为 1 mg/ml 的浓度,常用惟有浓度一般为 10 μg/ml。

结果入围者

巨噬细细胞核衰老每一次之前巨噬细细胞核内染质的灵长类变动分作三期:Ⅰ 期的巨噬细细胞核内长方形菱形状(rippled)或长方形竖缝样(creased),其余部分染质单单现挥发平衡状态;Ⅱa 期巨噬细细胞核内的染质相对汇聚、长期以来时;Ⅱb 期的巨噬细细胞核内氢化时为碎片,归因于衰老小棒状(三幅 1)。

发散电子上端径掩蔽

结果入围者

衰老巨噬细细胞核棒状积变小,巨噬细细胞核质挥发。衰老Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的巨噬细细胞核内内染质相对纤,单单现许多专指气穴持续性(citations)的空泡结构设而所;Ⅱa 期巨噬细细胞核内的染质相对汇聚、长期以来时;巨噬细细胞核衰老的后期,巨噬细细胞核内氢化时为碎片,归因于衰老小棒状(三幅 2)。

二Annexin V 法律条文

外表皮酰激蛋白(Phosphatidylserine, PS)也就是说位于巨噬细细胞核表皮的末端,但在巨噬细细胞核衰老的后期,PS 可从巨噬细细胞核表皮的末端倒置到巨噬细细胞核表皮的微小,暴露在巨噬细细胞核外环境之前(三幅 3)。Annexin-V 是一种水溶性为 35~36 KD 的 Ca2+ 依赖性外表皮紧密结合细细胞核内,能与 PS 高亲和力甲基化紧密结合。将 Annexin-V 来进行发光素(FITC、PE)或 biotin 上标,以上标了的 Annexin-V 作为发光间隙,能用流式巨噬细细胞核明为或发光上端径可侦测巨噬细细胞核衰老的遭遇。

铋时丙啶(propidine iodide, PI)是一种反应器酸染色,它没法更加进一步完整的巨噬细细胞核表皮,但在衰老之前后期的巨噬细细胞核和亡巨噬细细胞核,PI 很难更加进一步巨噬细细胞核表皮而使巨噬细细胞核内红染。因此将 Annexin-V 与 PI 意味着常用,就可以将衰老更早后期的巨噬细细胞核以及亡巨噬细细胞核区别于开去。

方法律条文有

吸附巨噬细细胞核的染:将也就是说培植和可借衰老的吸附巨噬细细胞核(0.5~1×106)用 PBS 浴 2 次,申请沙入 100 μl Binding Buffer 和 FITC 上标的 Annexin-V(20 μg/ml)10 μl,常温下避光 30 min,便申请沙入 PI(50 μg/ml)5 μl,避光质子化 5 min 后,申请沙入 400 μl Binding Buffer,尽快用 FACScan 来进行流式巨噬细细胞核妖术定常用量侦测(一般不少于 1 h), 同时以不沙 AnnexinV-FITC 及 PI 的一管作为阴性相异。

贴壁培植的巨噬细细胞核染:先用 0.25% 的胰蛋白消化系统时,冲浴、染和比对同吸附巨噬细细胞核。

爬片巨噬细细胞核染:同上,终于用发光上端径和共揭示脉冲扫描上端径来进行掩蔽。

结果

简要

1. 整个操作单手要尽常用量轻柔,切勿手掌吹打巨噬细细胞核。

2. 操作时请注意避光,质子化天内后尽快在一同一时间内侦测。

三线粒棒状表皮位能的侦测

线粒棒状在巨噬细细胞核衰老的每一次之前起着枢纽抑制作用,多种巨噬细细胞核衰老诱因生物体可选择可借各有不同的巨噬细细胞核遭遇衰老,而线粒棒状串连正向(Δψm)的急剧下降,被普遍认为是巨噬细细胞核衰老反馈质子化每一次之前最更早遭遇的政治事件,它遭遇在巨噬细细胞核内衰老特征(染质挥发、DNA 断裂)单单现之前,一旦线粒棒状串连正向瓦解,则巨噬细细胞核衰老不可逆转。

线粒棒状串连正向的长期存在,使一些官能团阳离子发光染色如 Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide(DiOC6)、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide(JC-1)、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可紧密结合到线粒棒状内皮,其发光的增强或消退说明线粒棒状血管壁电负性的增高或减缓。

方法律条文有

将也就是说培植的巨噬细细胞核和可借衰老的巨噬细细胞核申请沙入常用惟有浓度为 Rhodamine 123(1 mM)或惟有浓度为 DiOC6(25 nM),JC-1(1 mM),TMRM(100 nM),37 °C 适度 30 min,流式巨噬细细胞核而所侦测巨噬细细胞核的发光准确度。

简要

1. 始惟有间有染试管之前 pH 数值的一致性,因为 pH 数值的变异时将影响正向。

2. 与染色降至适度的巨噬细细胞核悬试管之前如果而所有有细细胞核内,他们将与其余部分染色紧密结合,减缓染色的浓度,引起真依赖性时。

四DNA 影片化时侦测

巨噬细细胞核衰老时主要的生化时特征是其染质遭遇挥发,染质 DNA 在反应器小棒状的单位两者之间的连接处断裂,转变变为 50~300 kbp 长的 DNA 大影片,或 180~200 bp 整数倍的寡反应器苷酸影片,在胶体上体现为梯形胶体三幅谱(DNA ladder)。

巨噬细细胞核经处理事件后,采行常规方法律条文有除去提纯 DNA,来进行琼脂糖胶体和溴化时乙啶染,在衰老巨噬细细胞核群之前可掩蔽到迥然不同的 DNA ladder。如果巨噬细细胞核常用量大多,还可在除去提纯 DNA 后,用 32P-ATP 和反应器苷酸反应器苷酸下侧鸟苷(TdT)上标 DNA,然后来进行胶体和收射自显影,掩蔽衰老巨噬细细胞核之前 DNA ladder 的转变变为。

大化学键染棒状 DNA 影片的推算出

巨噬细细胞核衰老的后期,染棒状断裂变为为 50~300 kbp 长的 DNA 大影片。所有少于一定水溶性形状的双链 DNA 化学键在琼脂糖液体之前的迁至速度各有不同。线性 DNA 的双螺旋曲率半径少于液体曲率半径时,即降至分辨力的极限。此时液体不便按水溶性的形状来筛分 DNA,DNA 像通过弯管一样,以其前端指向电场一极而通过液体,这种迁至种系统称之为「乌龟」。因此,巨噬细细胞核衰老后期归因于的 50~300 kbp 长的 DNA 大影片没法用普通的琼脂糖胶体来除去。

有时候采行脉冲胶体技妖术可圆满地解决这一疑问。这个方法律条文有是在液体上外沙线性的交变脉冲电场。每当电场顺时针变动后,大的 DNA 化学键便滞留在乌龟管之前,直至更加进一步电场轴向重取而代之定向后,才能继续向前顺时针移动。DNA 水溶性越大,这种重排所需的间隔时间就越长。当 DNA 化学键变换顺时针的间隔时间大于脉冲周期时,DNA 就可以按其水溶性形状分开。

DNA Ladder 推算出

方法律条文有

收变为巨噬细细胞核(1×107)结晶→巨噬细细胞核氢化时试管→13 000 rpm ×5 min→得来上清代,沙 1% SDS 和 RnaseA(5 mg/ml)56 °C,圈养 2 h→细细胞核内蛋白 K(2.5 mg/ml)37 °C,2 h→1/10 棒状积 3 mol/l 醋酸钠和 2.5 倍棒状积的的水无水甲苯结晶 DNA,4 °C 用餐→14 000 rpm×15 min→终于将结晶溶解在 TE buffer 之前,沙 DNA Loading Buffer→1.2% 琼脂糖胶体,EB 染并照相。

结果

衰老巨噬细细胞核 DNA 而所有常用量的流式巨噬细细胞核而所比对

方法律条文有

得来巨噬细细胞核→70% 的水甲苯(PBS 挥发)4 °C 单独用餐→PBS 冲浴,1 000 rpm × 10 min→RNase A(0.5 mg/ml)37 °C 消化系统时 30 min→PI(50 mg/ml)染,常温下避光 15 min→FACScan 比对 DNA 亚二倍棒状的转变变为及巨噬激蛋白的变异时。

结果

ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay

优点:敏感度高,适合于侦测少常用量试样,小其余部分衰老巨噬细细胞核。如临床光阴的组织侦测。

五TUNEL 法律条文

巨噬细细胞核衰老之前,染棒状 DNA 双链断裂或单链断裂而归因于大常用量的塑性 3'-OH 下侧,可在反应器苷酸反应器苷酸下侧鸟苷(TdT)的抑制作用下,将反应器苷酸反应器苷酸和发光素、过氧化时物蛋白、碱性磷酸蛋白或生物素转变变为的衍生物上标到 DNA 的 3'-下侧,从而可来进行衰老巨噬细细胞核的侦测,这类方法律条文有专指反应器苷酸反应器苷酸下侧鸟苷内源性的后方下侧上标法律条文(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于也就是说的或正在增殖的巨噬细细胞核几乎没有 DNA 的断裂,因而没有 3'-OH 转变变为,大多很难被染。TUNEL 显然是化学键生物学与灵长类相紧密结合的深入研究方法律条文有,对完整的单个衰老巨噬细细胞核内或衰老小棒状来进行则会染,能可靠地质子化巨噬细细胞核衰老迥然不同的生物化时学和有机体特征,可常用石蜡包埋的组织外皮、的水的组织外皮、培植的巨噬细细胞核和从的组织之前除去的巨噬细细胞核的巨噬细细胞核有机体推算出,并可侦测单单极少常用量的衰老巨噬细细胞核,因而在巨噬细细胞核衰老的深入研究之前被广泛采行。

六Caspase-3 光阴性的侦测

Caspase 的王室在内源性巨噬细细胞核衰老的每一次之前起着非常重要的抑制作用,其之前 Caspase-3 为决定性的指派化学键,它在衰老信号传递信息的许多简而言之之前展现功能。Caspase-3 也就是说以蛋白原(32 KD)的表达方式长期存在于细胞核浆之前,在衰老的后期先决条件,它被脉冲阴,酪氨酸时的 Caspase-3 由两个大蛋白(17 KD)和两个小蛋白(12 KD)组变为,氢化时相应的细胞核浆细胞核反应器质子化物,最惟有导致巨噬细细胞核衰老。但在巨噬细细胞核衰老的后期和被害巨噬细细胞核,Caspase-3 的光阴性明显急剧下降。

Western blot

比对 Procaspase-3 的酪氨酸时,以及酪氨酸时的 Caspase-3 及对质子化物多聚(ADP-反应器糖)催化反应(PARP)等的氢化时。

方法律条文有

得来巨噬细细胞核→PBS 冲浴→抽提巨噬细细胞核氢化时试管→细细胞核内定常用量→SDS-PAGE 胶体→乳胶表皮或 PVDF 表皮转移→5% 脱脂隔离,常温下 1.5~2 h 或 4 °C 用餐→Caspase-3 多抗或嘌呤常温下质子化 1~2 h 或 4 °C 用餐→TBS-T(而所有 0.05% Tween 20 的 TBS)浴 3 次,5~10 min/次→HRP-上标的绵羊抗鼠 IgG 或 AP 上标的绵羊抗鼠 IgG 常温下质子化 1~2 h→ TBS-T 浴 3 次, 5~10 min/次→ECL 显影或 NBT/BCIP 高锰酸钾。

结果

发光光谱学光学明为器比对

酪氨酸时的 Caspase-3 很难特异大块 D1E2V3D4-X 质子化物,过氧化氢 D4-X 抑制剂键。根据这一特性,设而所单单发光气态偶联的短抑制剂 Ac-DEVD-AMC。在配棒状偶联时,AMC 没法被可借发光,短抑制剂被过氧化氢后拘禁单单 AMC,种自由的 AMC 才能被可借发射成功发光。根据拘禁的 AMC 发光准确度的形状,可以推算出 Caspase-3 的光阴性,从而反映 Caspase-3 被酪氨酸时的程度。

方法律条文有

收变为巨噬细细胞核也就是说或衰老巨噬细细胞核→PBS 冲浴→制备巨噬细细胞核氢化时试管→沙 Ac-DEVD-AMC(caspase-3 发光质子化物)→37 °C 质子化 1 h→发光光谱学光学明为器(Polarstar)比对发光准确度(可借可见光 380 nm,发射成功可见光为 430~460 nm)。

结果

流式巨噬细细胞核妖术比对

方法律条文有

收变为巨噬细细胞核也就是说或衰老巨噬细细胞核→PBS 冲浴→沙 Ac-DEVD-AMC→37 °C 质子化 1 h→UV 流式巨噬细细胞核而所比对 Caspase-3 阳性巨噬细细胞核数和不等发光准确度。

结果

七TFAR19 细细胞核内理解和巨噬细细胞核聚焦比对

TFAR19(PDCD5)是由本深入研究室在国际上首先报导的一个拥有自己知识产权的生物取而代之基因组,后期的功能深入研究表明,它是促进巨噬细细胞核衰老的增强剂。能用发光素(FITC)上标的 TFAR19 单克隆抗棒状为间隙,对巨噬细细胞核衰老每一次之前 TFAR19 细细胞核内的理解素质及聚焦深入研究发现,衰老后期 TFAR19 理解素质增高并单单现快速反应器二分持续性,伴随着巨噬细细胞核内灵长类的变异时,持续较长间隔时间,在衰老小棒状之前一直可见。

同时我们发现,衰老后期 TFAR19 细细胞核内的反应器二分更早于外表皮酰激蛋白(PS)弓形和巨噬细细胞核内 DNA 的影片化时,示意 TFAR19 细细胞核内的反应器二分是巨噬细细胞核衰老更加后期遭遇的政治事件之一。进一步的深入研究验证,衰老后期 TFAR19 的反应器二分具有普遍意义,各有不同巨噬细细胞核衰老后期均单单现 TFAR19 高理解和反应器二分。这为深入研究巨噬细细胞核衰老后期所遭遇的政治事件,给予了一种更加进一步技妖术和这两项。

TFAR19 细细胞核内的巨噬细细胞核聚焦比对

金属材料醛

FITC 上标的单克隆抗棒状,pH 7.4 、0.15 mol/L PBS,3% 的多聚甲醛,PBS-T(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 而所有 0.2% Tween 20),胎牛胰岛素,发光巨噬细细胞核浴试管(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 而所有 2% 胎牛胰岛素及 0.1% NaN3),FACS 管,Tip 脚,移试管器。

明为器

环境温度素质超临界,37 °C 水浴罐,发光上端径,共揭示脉冲扫描上端径,流式巨噬细细胞核明为。

方法律条文有

1. 吸附巨噬细细胞核的染

(1)收变为也就是说和可借衰老的巨噬细细胞核(0.5~1×106),PBS 浴 2 次,1 000 rpm×10 min。

(2)3% 多聚甲醛冰浴 10 min,PBS 浴 2 次,1 000 rpm×10 min。

(3)申请沙入 PBS-T 溶试管,37 °C 圈养 15 min,PBS 浴 2 次,1 000 rpm×10 min。

(4)申请沙入 200 ml 胎牛胰岛素,常温下质子化 30 min。

(5)申请沙入 5 ml FITC 上标的 TFAR19 嘌呤(惟有浓度为 1:40),4 °C 质子化 30 min。

(6)发光巨噬细细胞核浴试管浴 2 次,1 000 rpm×10 min。

将巨噬细细胞核结晶滴片,发光上端径及共揭示脉冲上端径下掩蔽 TFAR19 在巨噬细细胞核之前的聚焦。同时用流式巨噬细细胞核明为定常用量侦测 TFAR19 细细胞核内的不等发光准确度。

2. 贴壁巨噬细细胞核的则会染

(1)贴壁生长的对数期巨噬细细胞核铺在 24 上端或 6 上端板子之前(内有洁净盖玻片),让其爬片生长,待长到 50%~80 % 满时,衰老可借剂处理事件巨噬细细胞核。

(2)将各有不同间隔时间点处理事件的巨噬细细胞核来进行免疫发光染,染步骤同上。

(3)将染的爬片巨噬细细胞核收于一张滴有少常用量(5 ml)的载玻片上,发光上端径或共揭示脉冲扫描上端径掩蔽 TFAR19 在巨噬细细胞核之前的聚焦。

3. 临床病理外皮的染、侦测

4. 原代巨噬细细胞核的培植、侦测

5. 比对 TFAR19 细细胞核内在人棒状内各的组织肝脏的分布及聚焦

TFAR19 细细胞核内的理解与临床哮喘

ELISA 法律条文侦测也就是说人和哮喘平衡状态下,以及哮喘的各有不同时期,胰岛素之前 TFAR19 细细胞核内素质及其 TFAR19 自身抗棒状素质。

金属材料和醛

1. 大块 Buffer:pH 9.6, 0.05 mol/L 盐类 Buffer

2. 冲浴试管: pH 7.4,0.15 mol/L PBS 而所有 0.05% Tween 20

3. 隔离试管: 3% BSA(用冲浴试管配制)

4. 蛋白标抗棒状的挥发:用隔离试管挥发

5. OPD 质子化物 Buffer:Na2 HPO4·12 H2O 1.84 g,柠檬酸 0.51 g,DDW 100 ml

6. 高锰酸钾试管(现配现用):质子化物 Buffer 10 ml,OPD 2 mg,30% H2O2 2 ml

7. 惟有止试管 2 mol/L H2SO4

8. 拆分人 TFAR19,HRP 上标的绵羊抗人 IgG9 ELISA 板子,Tip,移试管器,ELISA Reader(OD 490 nm),浴板子机

操作步骤

1. 用大块 Buffer 挥发的拆分人 TFAR19(1 mg/ml)大块 ELISA 板子,100 ml/well,37 °C 圈养 2 h 或 4 °C 用餐(一般 24 h 以上)。

2. 冲浴 Buffer 浴板子三次,申请沙入隔离试管,200 ml/well , 37 °C 圈养 2 h 或 4 °C 用餐。

3. 冲浴 Buffer 浴板子三次,申请沙入各有不同挥发度的治疗胰岛素(3 个重复上端)100 ml/well ,37 °C 圈养 1 h。设大块 Buffer、冲浴 Buffer 、隔离试管为阴性相异。

4. 冲浴 Buffer 浴板子三次,申请沙入 1:2 500 挥发的 HRP 上标的抗人 IgG, 100 ml/well,37 °C 圈养 1 h。

5. 冲浴 Buffer 浴板子三次,申请沙入高锰酸钾试管,100 ml/well,避光质子化 10~15 min。

6. 申请沙入 H2SO4 惟有止质子化,50 ml/well。

7. ELISA Reader 复制到 OD 490 光密度数值,比对和非常治疗胰岛素和也就是说胭脂 清代之前 TFAR19 自身抗棒状的理解素质。

8. Western blot 比对原发性巨噬细细胞核和也就是说巨噬细细胞核的 TFAR 19 细细胞核内的理解素质。

供参考

Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039

Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-5507

文章来源不明:丁香园中站友 midas

拍照信源地址

编辑: 任悠悠

分享:
成都美容整形医院 杭州整形医院 苏州整形医院/a> 北京整形医院 上海整形医院